| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sudeste. Para informações adicionais entre em contato com cppse.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
01/02/2018 |
|
Data da última atualização: |
07/11/2018 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
GEISTLINGER, L.; SILVA, V. H. da; CESAR, A. S. M.; TIZIOTO, P. C.; WALDRON, L.; ZIMMER, R.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L. |
|
Afiliação: |
Ludwig Geistlinger, Bolsista/Embrapa Pecuária Sudeste; Vinicius Henrique da Silva, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Polyana Cristine Tizioto, ESALQ/USP; Levi Waldron, University of New York; Ralf Zimmer, Ludwig Maximilians Universität München; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP. |
|
Título: |
Widespread modulation of gene expression by copy number variation in skeletal muscle. |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 8, n. 1399, p. 1-11, jan. 2018. |
|
DOI: |
10.1038/s41598-018-19782-4 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Copy number variation (CNV) is a frequently observed deviation from the diploid state due to duplication or deletion of genomic regions. Although intensively analyzed for association with diseases and production traits, the specific mechanisms and extent by which such variations affect the phenotype are incompletely understood. We present an integrative study on CNV and genome-wide gene expression in Brazilian Bos indicus cattle. We analyzed CNVs inferred from SNP-chip data for effects on gene expression measured with RNA-seq in skeletal muscle samples of 183 steers. Local effects, where expression changes coincided with CNVs in the respective genes, were restricted to immune genes. Distal effects were attributable to several high-impact CNVs that modulated remote expression in an orchestrated and intertwined fashion. These CNVs were located in the vicinity of major skeletal muscle pathway regulators and associated genes were enriched for proteolysis, autophagy, and muscle structure development. From association analysis between CNVs and several meat quality and production traits, we found CNV-associated expression effects to also manifest at the phenotype level. Based on genome sequences of the population founders, we further demonstrate that CNVs with impact on expression and phenotype are passed on from one generation to another. |
|
Palavras-Chave: |
Agricultural genetics; Nellore cattle. |
|
Thesaurus Nal: |
gene expression. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
Marc: |
LEADER 02111naa a2200253 a 4500
001 2086932
005 2018-11-07
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1038/s41598-018-19782-4$2DOI
100 1 $aGEISTLINGER, L.
245 $aWidespread modulation of gene expression by copy number variation in skeletal muscle.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aCopy number variation (CNV) is a frequently observed deviation from the diploid state due to duplication or deletion of genomic regions. Although intensively analyzed for association with diseases and production traits, the specific mechanisms and extent by which such variations affect the phenotype are incompletely understood. We present an integrative study on CNV and genome-wide gene expression in Brazilian Bos indicus cattle. We analyzed CNVs inferred from SNP-chip data for effects on gene expression measured with RNA-seq in skeletal muscle samples of 183 steers. Local effects, where expression changes coincided with CNVs in the respective genes, were restricted to immune genes. Distal effects were attributable to several high-impact CNVs that modulated remote expression in an orchestrated and intertwined fashion. These CNVs were located in the vicinity of major skeletal muscle pathway regulators and associated genes were enriched for proteolysis, autophagy, and muscle structure development. From association analysis between CNVs and several meat quality and production traits, we found CNV-associated expression effects to also manifest at the phenotype level. Based on genome sequences of the population founders, we further demonstrate that CNVs with impact on expression and phenotype are passed on from one generation to another.
650 $agene expression
653 $aAgricultural genetics
653 $aNellore cattle
700 1 $aSILVA, V. H. da
700 1 $aCESAR, A. S. M.
700 1 $aTIZIOTO, P. C.
700 1 $aWALDRON, L.
700 1 $aZIMMER, R.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
773 $tScientific Reports$gv. 8, n. 1399, p. 1-11, jan. 2018.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
|
Data corrente: |
31/01/2018 |
|
Data da última atualização: |
01/12/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
MACEDO, A. de; CAMPOS, F. S.; GOIS, G. C.; ARAUJO, G. G. L. de; REGITANO NETO, A.; TABOSA, J. N.; SIGNOR, D.; MAGALHÃES, A. L. R. |
|
Afiliação: |
AMÉLIA DE MACEDO, UPE; FLEMING SENA CAMPOS, UFRPE/UAG; GLAYCIANE COSTA GOIS; GHERMAN GARCIA LEAL DE ARAUJO, CPATSA; AMADEU REGITANO NETO, CPATSA; JOSÉ NILDO TABOSA, IPA; DIANA SIGNOR DEON, CPATSA; ANDRÉ LUIZ RODRIGUES MAGALHÃES, UFRPE/UAG. |
|
Título: |
Avaliação da emergência e crescimento inicial de plântulas de sementes de milheto. |
|
Ano de publicação: |
2017 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 18.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE RUMINANTES, 5.; SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE FORRAGICULTURA E PASTAGENS, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE CONSERVAÇÃO E UTILIZAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO SOBRE AMBIÊNCIA, BEM-ESTAR ANIMAL E CONVIVÊNCIA COM O SEMIÁRIDO, 1.; SIMPÓSIO IMPORTÂNCIA DAS PASTAGENS NATIVAS PARA A SUSTENTABILIDADE PECUÁRIA NO SEMIÁRIDO; FÓRUM DE COORDENADORES DE PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOTECNIA E RECURSOS PESQUEIROS DO NORDESTE, 7.; FÓRUM DE INTEGRAÇÃO ENTRE A ACADEMIA, AGENTES DE EXTENSÃO RURAL E PRODUTORES, 1. 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. |
|
Páginas: |
p. 2579-2581. |
|
Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Germinação e emergência de plântulas é o ponto de partida para o crescimento e processo de desenvolvimento de todas as plantas de cultivo anual, portanto, é necessária uma boa germinação e emergência de sementes se for alcançado alto rendimento. Objetivou-se avaliar a emergência e o crescimento inicial de plântulas de diferentes lotes de milheto. O presente experimento foi realizado em casa de vegetação, onde foram analisadas as seguintes variáveis: emergência (porcentagem de plântulas normais, plântulas anormais e sementes duras), comprimentos e pesos da parte aérea e da raiz de seis lotes de sementes de milheto irrigados com água doce e salina. Os cultivares utilizados foram: BRS 1501, ADR 300 e IPA Bulk-1-BF. De acordo com os resultados obtidos, o genótipo IPA Bulk-1-BF quando irrigado com água salina, demonstrou resultados superiores aos demais genótipos em todas as características avaliadas. Já para o tratamento com água salina, o ADR 300 demonstrou melhores resultados quanto a emergência e comprimentos pesos de raiz e parte aérea, sendo recomendado para irrigação com água salina. |
|
Palavras-Chave: |
Nutrição amimal. |
|
Thesagro: |
Água Salina; Gramínea forrageira; Milheto; Pennisetum Glaucum; Semente. |
|
Thesaurus NAL: |
Animal nutrition; Millets; Seeds. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/186102/1/Avaliacao-da-emergencia....pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02946nam a2200313 a 4500
001 2086832
005 2023-12-01
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aMACEDO, A. de
245 $aAvaliação da emergência e crescimento inicial de plântulas de sementes de milheto.$h[electronic resource]
260 $aIn: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 18.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE RUMINANTES, 5.; SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE FORRAGICULTURA E PASTAGENS, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE CONSERVAÇÃO E UTILIZAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO SOBRE AMBIÊNCIA, BEM-ESTAR ANIMAL E CONVIVÊNCIA COM O SEMIÁRIDO, 1.; SIMPÓSIO IMPORTÂNCIA DAS PASTAGENS NATIVAS PARA A SUSTENTABILIDADE PECUÁRIA NO SEMIÁRIDO; FÓRUM DE COORDENADORES DE PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOTECNIA E RECURSOS PESQUEIROS DO NORDESTE, 7.; FÓRUM DE INTEGRAÇÃO ENTRE A ACADEMIA, AGENTES DE EXTENSÃO RURAL E PRODUTORES, 1. 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco$c2017
300 $ap. 2579-2581.$c1 CD-ROM.
520 $aGerminação e emergência de plântulas é o ponto de partida para o crescimento e processo de desenvolvimento de todas as plantas de cultivo anual, portanto, é necessária uma boa germinação e emergência de sementes se for alcançado alto rendimento. Objetivou-se avaliar a emergência e o crescimento inicial de plântulas de diferentes lotes de milheto. O presente experimento foi realizado em casa de vegetação, onde foram analisadas as seguintes variáveis: emergência (porcentagem de plântulas normais, plântulas anormais e sementes duras), comprimentos e pesos da parte aérea e da raiz de seis lotes de sementes de milheto irrigados com água doce e salina. Os cultivares utilizados foram: BRS 1501, ADR 300 e IPA Bulk-1-BF. De acordo com os resultados obtidos, o genótipo IPA Bulk-1-BF quando irrigado com água salina, demonstrou resultados superiores aos demais genótipos em todas as características avaliadas. Já para o tratamento com água salina, o ADR 300 demonstrou melhores resultados quanto a emergência e comprimentos pesos de raiz e parte aérea, sendo recomendado para irrigação com água salina.
650 $aAnimal nutrition
650 $aMillets
650 $aSeeds
650 $aÁgua Salina
650 $aGramínea forrageira
650 $aMilheto
650 $aPennisetum Glaucum
650 $aSemente
653 $aNutrição amimal
700 1 $aCAMPOS, F. S.
700 1 $aGOIS, G. C.
700 1 $aARAUJO, G. G. L. de
700 1 $aREGITANO NETO, A.
700 1 $aTABOSA, J. N.
700 1 $aSIGNOR, D.
700 1 $aMAGALHÃES, A. L. R.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
